辰山植物园重点实验室第24期meto学术沙龙顺利举办

　　2023年6月12日下午，由上海市资源植物功能基因组学重点实验室组织举办的第24期meto学术沙龙在辰山科研人员的期待中如约而至。本次沙龙有幸邀请到了来自法国斯特拉斯堡大学植物细胞与分子生物学研究所Léon Otten教授以及复旦大学附属中山医院郝洁研究员，为科研中心师生作了精彩的报告。Léon Otten教授报告题目为“Extensive natural transformation in the genus Camellia : recent findings and implications”，郝洁研究员报告题目为“机器学习新算法在深度挖掘生物多组学大数据的研究”。

　　Léon Otten教授博识广闻，幽默风趣，开场用清晰流畅的中文作了自我介绍，并高度赞赏了辰山的科研环境，赢得了满堂掌声。随后，他从cT-DNA研究的科学史开始，由浅入深的讲述了自己关于山茶cT-DNA的相关研究。山茶是一种天然转基因植物（植物基因组上含有细菌来源的T-DNA序列）。通过对山茶属舒茶早（C. sinensis var. sinensis cv. Shuchazao）的基因组比对分析，发现了一个来自于农杆菌T-DNA的片段，长5.5 kb，并命名为CaTA。Léon Otten教授表示，山茶基因组上不止含有一条T-DNA片段，而是很多条，总长度超过300kb。他系统展示了不同山茶品种的T-DNA序列示意图。从不同品种的山茶含有不同细菌来源的T-DNA，并且这些序列上有很多完整的基因开放阅读框，推测由农杆菌转染引起的山茶科基因组含有T-DNA片段事件，很可能对山茶科的生长发育及进化有重要影响。

　　郝洁研究员为上海市第九人民医院兼聘高级专家，英国帝国理工大学荣誉研究员，上海市浦江人才。她长期致力于生物信息学，多细胞组学等方面研究，她首先指出，生物组学测序技术普遍存在的较大噪声和生物信息挖掘不全问题，然后介绍自己为解决这些问题而开发的scSTAR、scCODE等算法，对生物组学数据进行优化处理，以及该算法在医学和植物中的应用。郝教授详细介绍了开发方法，真实数据验证结果和研究心得等。报告结束后，面对在座师生的提问，郝洁研究员耐心解答，从生物信息学的视角，为科学研究提供了新的思路。

　　本次学术沙龙由茄科进化与代谢研究组青年课题组长陈可副研究员主持。会后胡永红执行园长代表辰山植物园为Léon Otten教授和郝洁研究员颁发荣誉证书，感谢他们在促进辰山学术交流工作中所做出的贡献。