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上海市资源植物功能基因组学实验室
中国上海市松江区辰花路3888号
上海辰山植物科学研究中心
邮编 201632
电话(021)37792288
传真(021)67657811
茄科进化与代谢研究组

代表性成果


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研究组长:陈可,博士,青年研究员

通讯地址:上海市松江区辰花路3888号,中国科学院上海辰山植物科学研究中心(201602)

电话:021-37792288-907

邮箱:chenke@csnbgsh.cn













  陈可,2016年3月获得细胞与分子生物学博士学位(法国国家科学院植物细胞分子生物学研究所,斯特拉斯堡大学,法国;Institut de biologie moléculaire des plantes , Centre National de la Recherche Scientifique, Université de Strasbourg,France )。2016年至2021年在上海交通大学系统生物医学研究院任助理研究员。2021年6月加入上海辰山植物园(中国科学院上海辰山植物科学研究中心),任茄科进化与代谢组青年课题组长(Junior PI)。主持国家自然科学基金,上海市绿容绿化管理局专项基金,上海市“扬帆计划”人才计划,上海市“青年英才”计划,上海交大医工交叉基金等。研究方向为茄科功能基因研究,比较基因组学,代谢组学等。


研究领域

  茄科植物功能基因解析,生长状态研究,代谢组学,单细胞组学等多组学数据信息深度挖掘及细胞工程研究


研究内容

  1)可塑性基因家族对茄科植物生长性状调控 

  2)茄科植物cT-DNA序列及功能研究 

  3)植物生物工程技术及功能基因相关的小分子代谢调控


科研成果

学术论文

  1. Ke Chen#, Peter Zhurbenko#, Lavrentii Danilov, Tatiana Matveeva and Léon Otten*. Conservation of an Agrobacterium cT-DNA Insert in Camellia Section Thea Reveals the Ancient Origin of Tea Plants from a Genetically Modified Ancestor, Frontiers in Plant Science, 2022, 6;13:997762.

  2. Jiawei Zou, Fulan Deng, Miaochen Wang, Zhen Zhang, Zheqi Liu, Xiaobin Zhang, Rong Hua, Ke Chen*, Xin Zou*, Jie Hao*, scCODE:an R package for data-specific differentially expressed gene detection on single-cell RNA-sequencing data, Brief Bioinform, 2022, 23;bbac180.

  3. Léon Otten, T‑DNA regions from 350 Agrobacterium genomes: maps and phylogeny, Plant Molecular Biology, 2021, 106:239–258.

  4. Tatiana V Matveeva, Léon Otten*. Opine biosynthesis in naturally transgenic plants: Genes and products." Phytochemistry, 2021, 189: 112813.

  5. Xin Zou#, Ke Chen#, Jiawei Zou, Peiyi Han, Jie Hao, Zeguang Han, The single-cell RNA-seq data analysis on the receptor ACE2 expression reveals the potential risk of different human organs vulnerable to Wuhan 2019-nCoV infection, Frontiers of medicine, 2020, 14(2):185-192.

  6. Thomas Potuschak, Javier Palatnik, Carla Schommer, Nicolas Sierro, Nikolai V Ivanov, Yerim Kwon, Pascal Genschik, Jean-Michel Davière, Léon Otten*, Inhibition of Arabidopsis thaliana CIN-like TCP transcription factors by Agrobacterium T-DNA-encoded 6B proteins, Plant Journal, 2020, 101(6):1303-1317.

  7. Tatiana V Matveeva, Léon Otten*, Widespread occurrence of natural genetic transformation of plants by Agrobacterium, Plant Mol Biol, 2019,101(4-5):415-437.

  8. Léon Otten*, The Agrobacterium Phenotypic Plasticity (Plast) Genes, Curr Top Microbiol Immunol, 2018, 418:375-419.

  9. Ke Chen, François Dorlhac de Borne, Nicolas Sierro, Nikolai V. Ivanov, Malek Alouia, Sandrine Koechler, Léon Otten*, Organization of the TC and TE cT-DNA regions in Nicotiana otophora and functional analysis of three diverged TE-6b genes, Plant Journal, 2018, 94(2):274-287.


发明专利

  1. 一种植物生长基因与发育阶段和细胞类型关系判定方法。202211166112.5。

  2. 一种植物生长发育动态监控的方法。202211200145.7。

  3. 抑制新型冠状病毒SARS-CoV-2感染宿主细胞的多肽及其应用。CN202010450107.1。

  4. 一种基于核磁共振谱洛伦兹曲线数学性质的小波去噪方法。CN201810953635.1。

  5. 一种独立计算具有90度相位差的洛伦兹曲线参数的方法。CN201810906851.0。



研究组成员


科学顾问

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Léon Otten

法国国家科学院,斯特拉斯堡大学,植物细胞与分子生物研究所,教授









研究助理


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王卫青

硕士,助理研究员

电 话:021-37792288-952

邮 箱:piaoyao00520@163.com

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王卫青

硕士,助理研究员

电 话:021-37792288-952

邮 箱:piaoyao00520@163.com









学生


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莫运昕

在读硕士

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雷欢

在读硕士